Microsoft Word S. C. Salayeva, Avtoreferat doc
Yüklə 487,86 Kb. Pdf görüntüsü
|
- Bu səhifədəki naviqasiya:
- 4.2. Genetik müxtəlifliyin nüvə mikrosatellit lokusları əsasında tədqiqi
10 test”i ilə statistik yolla təsdiqlənmiş asılılıq müəyyən edilmişdir (Şək. 4.1). Bu nəticə gələcəkdə cari fraqmentin SCAR (Sequence Characterized Amplified Region - nukleotid ardıcıllığı xarakterizə olunmuş amplifikasiya edilmiş region) markerinə çevrilməklə, resveratrolun yüksək və ya az miqdarına malik genotiplərin qısa zaman fasiləsində identifikasiya olunmasında əhəmiyyətlidir.
Klaster analizi nəticəsində Cakkard genetik oxşarlıq indeksinin 0.508-ə bərabər qiymətində bütün nümunələr 9 qrupa ayrılmışlar. RAPD markerlərinin klaster analizi nəinki tədqiq olunmuş mədəni və yabanı üzüm nümunələrinin genetik müxtəlifliyi arasında kəskin fərqin olmadığını, həmçinin onların genetik müxtəlifliyi ilə coğrafi müxtəliflikləri arasında da müəyyən asılılığın olmadığını göstərdi. Hər bir populyasiya daxilində təyin edilmiş Nei genetik müxtəliflik indeksinin qiymətlərinə əsasən, genetik müxtəlifliyin yüksək səviyyəsi Abşeron yarımadasına məxsus mədəni üzüm populyasiyasında (0.852), nisbətən aşağı səviyyəsi Nabran və Quba bölgələrinə məxsus yabanı üzüm populyasiyalarında (uyğun olaraq, 0.824 və 0.793) izlənilmiş, Şabran zonasına məxsus üzüm populyasiyası isə zəif genetik müxtəlifliklə (0.765) səciyyələnmişdir. Nei genetik məsafə indeksi əsasında qurulmuş, üzüm populyasiyaları arasında genetik məsafəni təyin edən dendroqramda yalnız sortlardan ibarət üzüm populyasiyası tədqiq olunmuş üç yabanı üzüm populyasiyasından uzaq genetik məsafədə (0.36) yerləşməklə, onlardan xeyli fərqlənmişdir. Şabran və Nabran zonalarına aid olan üzüm populyasiyalarının bir-birindən çox kiçik genetik məsafədə (bu iki üzüm populyasiyası arasında Nei genetik oxşarlıq indeksi 0.95-ə bərabərdir) ayrılması bu iki zonaya məxsus nümunələrin genetik cəhətdən xeyli yaxın olduqlarını göstərir. Quba zonasına məxsus nümunələr isə digər yabanı üzüm populyasiyalarından nisbətən uzaqda (0.54) qruplaşmışlar.
11
65 üzüm genotipinin nüvə genomunda 15 mikrosatellit lokusu üzrə 184 müxtəlif allel aşkar olunmuşdur (Cədvəl 4.2). Bu mikrosatellit lokuslarından VVMD24 üzrə 6 allel olmaqla ən zəif, VVMD36 üzrə isə 20 allel olmaqla ən yüksək variabellik müşahidə edilmişdir. Bütün lokuslar üzrə allellərin orta qiyməti 12.26-ya, effektiv allellərin orta sayı isə 5.79-a bərabər olmuşdur ki, bu da hər bir lokus üzrə nadir allellərin varlığından xəbər verir. Tədqiqatda hər bir lokusda rast gəlinmiş nadir allellər müəyyənləşdirilmiş (184 alleldən 80-ni nadir allellər qrupuna aiddir), onların mədəni və yabanı üzüm populyasiyalarında rastgəlmə tezlikləri hesablanmışdır. Nadir allellərin təyini genotiplərin tanınması və pasportlaşdırılmasında, üzüm kolleksiyalarının səciyyələndirilməsində, həmçinin seleksiya işlərində seleksiyaçının müəllif hüququnun qorunub saxlanılmasında əhəmiyyətlidir. Cədvəl 4.2 15 nüvə mikrosatellit lokusu üzrə tədqiq olunmuş genetik parametrlər Lokuslar N a
e
H e H
o
ST N
PI
PIC R
VVMD5 12 14.97
0.799 0.754 0.09 2.31 0.061 0.764 0.02 VVMD6 9
3.17 0.68 0.631 0.14 1.52 0.13 0.645 0.03
VVMD7 10 4.84 0.79 0.985 0.17 1.24 0.066 0.751 -0.1
VVMD8 11 4.87 0.79 0.492 0.15 1.37 0.065 0.73 0.17 VVMD21 11 3.45 0.71 0.723 0.12 1.79 0.12 0.61 -0.01 VVMD24 6 3.11 0.68 0.723 0.07 3.18 0.143 0.63 -0.07 VVMD25 12 4.67 0.79 0.615 0.07 2.93 0.067 0.71 0.097 VVMD27 14 4.56 0.786 0.677 0.17 1.21 0.047 0.72 0.06 VVMD28 18 9.63 0.892 0.8 0.08 2.87 0.018 0.855 0.048
VVMD31 9 4.34 0.769 0.754 0.05 4.41 0.088 0.63 0.025 VVMD32 13 8.06 0.876 0.815 0.12 1.86 0.027 0.76 0.032 VVMD36 20 9.13 0.89 0.738 0.07 3.34 0.019 0.81 0.08 VVS2 15 9.23
0.89 0.877
0.05 4.97 0.045 0.8 0.007 VrZAG62 9 6.85 0.85 0.769 0.15 1.38 0.039 0.75 0.04 VrZAG79 15 6 0.83 0.892 0.1 2.22 0.038 0.734 -0.03
Orta qiymət
12.26 5.79 0.802 0.749 0.11 2.44 0.065 0.726 0.052
N a -allellərin sayı; N e -effektiv allellərin sayı; H e -gözlənilən heteroziqotluq; H o -müşahidə olunan heteroziqotluq; F ST -fiksasiya indeksi; N m -gen axını; PI-(probability of identity) eynilik ehtimalı; PIC-(polymorphic information content) polimorf informasiyanın ölçüsü; r-"sıfır” allellərinin tezliyidir.
Müşahidə olunan heteroziqotluq və PIC kəmiyyətlərinin qiymətləndirilməsi nəticəsində genetik müxtəlifliyin ən yüksək qiyməti VVMD28, VVMD36 və VVS2 lokusları, ən kiçik qiyməti isə VVMD24 lokusu üzrə müəyyən edilmişdir. VVMD28 və VVMD36 praymerləri yüksək genetik müxtəlifliyi təyin etməklə yanaşı, PI-ın kiçik qiymətləri ilə səciyyələnməklə mədəni və yabanı üzüm nümunələrinin genetik
Yüklə 487,86 Kb. Dostları ilə paylaş:
|