Created by the

Jaguar (Panthera onca) Care Manual  
 
Association of Zoos and Aquariums
 
119 
 
Appendix K: Necropsy Protocol and Tissue Collection Instructions 
 
AZA JAGUAR SSP NECROPSY PROTOCOL 
INSTITUTION/OWNER 
ADDRESS 
 
JAGUAR NAME OR ID # ______________ STUD BOOK # _________ SEX ______ 
BIRTH DATE/AGE _______________          WEIGHT ______________ 
DATE OF DEATH ________________         DATE OF NECROPSY ______________ 
BRIEF HISTORY (circumstances of death); 
 
 
SHIPPING TISSUES: PLEASE OBTAIN PROPER CITES IMPORT  AND EXPORT PERMITS BEFORE 
SHIPPING TISSUES INTERNATIONALLY.  
SHIP FROZEN TISSUES IN SEPARATE CONTAINERS FROM FIXED TISSUES. 
After 72 hours in fixative, ship tissues in a leak-proof container in adequate formalin to keep tissues moist. 
Frozen tissues should be shipped with adequate dry ice to stay frozen for 72 hours. Tissues can be 
shipped by U.S. Mail or by courier to: 
 
Dr. Dalen Agnew 
Attn: Histo Research 
Diagnostic Center for Population & Animal Health 
4125 Beaumont Road 
Lansing, MI USA 48910-8104 
phone: [phone] 
email: 
[e-mail]
 
 
PROTOCOLS FOR FELID REPRODUCTIVE TISSUE PATHOLOGY AND GENE RESCUE 
 
Please note that pathology protocols have not changed. For any felids in contraception studies or with 
any apparent lesions of the reproductive tissue, tracts should still be fixed in 10% formalin, accompanied 
by form for the contraceptive studies and shipped to: 
 
Dr. Dalen Agnew 
Attn: Histo Research 
Diagnostic Center for Population & Animal Health 
4125 Beaumont Road 
Lansing, MI USA 48910-8104 
phone: [phone] 
email: 
[e-mail]
 
 
Contact the laboratory, if necessary, to confirm labeling requirements and/or shipping restrictions. 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

---

Jaguar (Panthera onca) Care Manual  
 
Association of Zoos and Aquariums
 
120 
Appendix L: Protocol for Labeling and Sending Fecal Samples for 
Fecal Steroid Analysis 
 
Labeling and sending fecal samples 
Contact  Dr.  Janine Brown at Smithsonian Conservation Biology Institute  ([e-mail]) to 
discuss schedules and cost of tests. Fecal samples should be collected every other day and placed 
in re-sealable plastic bags with a clear label including animal ID (name and studbook number), date 
of collection, and a.m. or p.m. collection. Bags and labels can be obtained from SCBI. Samples 
should be frozen immediately and kept frozen until they are sent. Samples will be processed and 
analyzed for steroid metabolites using procedures validated for other felid species (Brown et al., 
1994). If at all possible, samples should be dried in a lyophilizer or oven at 70 °C (158 °F) for three 
days (Terio et al., 2002). Once dried, samples can remain in a dry place at room temperature. Before 
drying, all samples should remain frozen, and should be shipped on dry ice. 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

---

Jaguar (Panthera onca) Care Manual  
 
Association of Zoos and Aquariums
 
121 
Appendix M: Enrichment Examples, Surveys, Problems, and Rating 
Charts 
ENRICHMENT EXAMPLES (Law, 2009) 
Night Holding: A resting platform for each cat. Logs and stumps for scent marking and 
sharpening claws. 
Outside Exhibit: Usually natural substrate like grass or dirt is preferred (see Chapters 1 and 2). 
Logs can be hung, attached, or on the ground. There should be plenty of visual barriers for the 
animal to feel  completely hidden from the public. The exhibit should have plenty of vertical 
perching for climbing including real or artificial logs, branches or rocks, and various high nesting 
sites. The top of the cage should have plenty of natural coverage for shade and security. There 
should be at least one water source. A heat or cold rock can  encourage the jaguar to be in a 
favorable viewing area as well as keep the animal comfortable in hot or cold weather. Pools, 
ponds, and streams are recommended for drinking, playing, and cooling off. 
Novel Objects: Objects such as boomer balls and cardboard boxes promote the natural stalk 
and pouncing behavior. Small logs can also be used on exhibits for a natural look. 
Natural Feeding: “In order to provide opportunities to exhibit species-appropriate behaviors or 
otherwise enable animals to work for food, a number of enrichment items can be added to their 
outdoor or indoor enclosure and exhibits. It is recommended that large felids be offered edible 
(or other) items on an ongoing but random schedule in order to combat stereotypic behaviors 
such as pacing, hair pulling or self-mutilation as well as to add more interest to their daily lives. 
Offering items at random is important as felids easily become desensitized; offering no 
enrichment on some days may be equally as effective. Food items from non-domestic  stock 
should be frozen prior to feeding to kill any pathogens that might be present” (Shoemaker, 2003). 
 
Carcass Feeding: Because feeding live mammal or bird prey is not typically desirable or 
feasible, other techniques should be employed to provide appetitive or “hunting” 
opportunities for managed felids. Providing humanely-killed animals to jaguars can promote 
a wide range of species-appropriate hunting, food manipulation, and feeding behaviors. 
Whole animals (e.g., rats, mice), gutted carcasses (e.g., chickens, rabbits), or carcass 
fragments (e.g., shanks of sheep or calf) can be provided. On receiving whole or partial 
carcasses, many cats exhibit all or part of the stalk-rush-kill sequence (Richardson, 1982; 
J. Mellen, personal communication; D. Shepherdson, personal communication). In addition 
to the potential for improved psychological well-being (Lindburgh, 1988), feeding whole 
carcasses may enhance physical well-being (Shepherdson, Mellen & Hutchins, 1998). 
 
Olfactory:  Olfactory enrichment can encourage natural behaviors such as scent marking and 
exploratory behavior. Extracts such as spices and perfumes as well as different hunting scents 
and animal fur or feathers can be used. It is recommended to freeze items from other animals to 
remove parasites. One institution reports the use of urine from other species, centrifuged and 
examined for bacteria, as well. It is strongly recommended to obtain veterinary approval of any 
and all animal material before using it as enrichment. 
Auditory: Auditory enrichment allows the jaguar to use their excellent hearing senses. Hearing 
possible prey animals or another jaguar can stimulate exploratory behavior. A radio can be 
stimulating or comforting for a jaguar. 
Social:  Social enrichment can decrease pacing and add a stimulating change to the day. 
Keeper interaction and visuals of other animals are two examples of social enrichment that can 
increase the complexity of a jaguar’s day. 

---