Committee chairman: Prof a t dronsfield

paper world still play in today’s electronic environment. Real and potential 

changes  concerning  e-journals,  e-books,  and  databases,  are  driven  by 

opportunities  provided  by  technology,  and  by  changed  user  perception  and 

behaviour.  Compared  to  other  sciences,  however,  the  present  system  of 

chemical  literature  and  its  major  players  (such  as  abstraction  services)  are 

rather conservative, and dominated by commercial interests. 

After lunch in the Chemistry Centre (during which time Prof. David Phillips, 

the  new  RSC  President,  welcomed  guests),  the  sessions  continued  with 

Diana Leitch as chairman. 

Dr 

Phil 

McHale 

(Executive 

Director, 

Enterprise 

Information, 

CambridgeSoft Corporation, USA); Chemical Structures 

Representations  of  chemical  structures,  whether  hand-drawn  on  a  napkin, 

displayed  on  a  screen  or  printed  in  a  journal  or  patent,  provide  a  lingua 

franca for chemists, and the language of chemical structures has evolved to 

keep pace with our increasing understanding of the nature of bonds and the 

spatial arrangements of atoms within molecules. Some early dialects such as 

linear  formulae  only  conveyed  partial  information,  and  the  apparently 

complete  descriptions  afforded  by  linear  notations  were  reserved  for  the 

cognoscenti and spoken by very few practising chemists. The talk surveyed 

this  evolution  in  handling  structures  and  illustrated  how  parallel 

developments  in  structural  representation,  technology  (graphics  terminals), 

and informatics (connection tables) have made handling chemical structures 

a  commonplace  activity,  and  have  increased  the  roles  which  structures  can 

play in chemistry-related endeavours. 

Dr Helen Cooke (R&D IT, GlaxoSmithKline, Philadelphia); Databases 

Chemists  think  and  communicate  structures,  and  chemists’  information 

requirements  are  mostly  compound,  structure  and  reaction  centric. The 

ability to search information sources (printed and electronic) by structure has 

been  the  focus  of  chemical  information,  and  has  differentiated  chemical 

information  systems  from  those  for  other  disciplines.  This  has  brought 

specific challenges regarding the electronic storage and retrieval of chemical 

information, necessitating many innovations to develop solutions. Chemical 

structure-based databases have been essential tools to enable chemists to find 

information for over thirty years. This talk presented a brief history of their 

development,  including  an  overview  of  the  drivers  (e.g.  the  literature 

explosion,  the  need  for  timely  information  in  the  pharmaceutical  and 

chemical  industries),  precursors  (e.g.  punched  cards),  and  enablers  (e.g. 

advances in telecommunications, development of codes to enable storage of 

structures  by  computers).  Landmarks  in  the  development  and  evolution  of 

chemical  structure  databases  from  the  1970sto  the  early  2000s  were  

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highlighted. The  presenter’s  own  experiences  as  a  chemical  information 

specialist were included throughout, with reflections on the changing role of 

librarians and information scientists, the evolving search experience, and the 

re-empowerment of end-user searchers. 

Professor  Alexander  Lawson  (Director  of  R&D,  Elsevier  Properties  SA, 

Neuchâtel); Data: The Record of What we Think we Know, and Why 

The history of data collections in chemistry has been strongly influenced not 

only by the need for standardization of definitions of terms, but also by two 

further  time-dependent  factors:  the  evolution  of  data  to  information  (and 

ultimately knowledge), and the practical needs of the user community. The 

talk  discussed  these  trends  with  respect  to  the  continuous  development  of 

major databases in the core areas of organic and inorganic chemistry. 

Professor  Peter  Willett  (Information  School,  University  of  Sheffield); 

Chemoinformatics: Historical Development of Database Methods 

The  term  ‘chemoinformatics’  only  started  to  be  used  at  the  end  of  the  last 

century, but many of its constituent techniques have been studied for many 

years. This talk provided an historical overview of its development since its 

genesis  in  studies  of  methods  for  searching  databases  and  predicting 

biological  properties  that  took  place  in  the  late  Fifties  and  early  Sixties  (1, 

2).  It  focused  on  the  former  methods,  with  only  passing  mention  of  the 

concurrent development of QSAR and modelling techniques. The following 

areas  were  mentioned:  substructure  and  similarity  searching  in  files  of  2D 

chemical  structures;  the  representation  and  searching  of  chemical  reactions 

and  of  the  generic  structures  that  characterise  many  chemical  patents; 

computer-aided  synthesis  design  as  an  example  of  an  artificial  intelligence 

application  in  chemoinformatics;  the  searching  of  pharmacophoric  patterns 

in  databases  of  3D  chemical  structures;  protein-ligand  docking;  and  more 

recent studies of molecular diversity and drug-likeness. Current key areas of 

research  include  the  prediction  of  the  ADME  and  toxicity  properties  of 

molecules, and studies of a range of methods for virtual screening.  

W.  L.  Chen,  “Chemoinformatics:  past,  present  and  future,”  Journal  of 

Chemical Information and Modeling, 2006, 46, 2230-2255. 

P.  Willett,  “From  chemical  documentation  to  chemoinformatics:  fifty  years 

of chemical information science,” Journal of Information Science, 2008, 34, 

477-499. 

Professor Robert Glen (Unilever Centre for Molecular Science Informatics, 

University of Cambridge); Chemical Information: The Future 

William Gibson said “The future is here. It's just not widely distributed yet.” 

The means to make all of chemical knowledge available on demand is surely  

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