27-amaliy mashg`ulot. Genomni kаrtаlаshtirish Gen xaritalash yoki genom xaritalash xromosomadagi genning joylashishini

Xaritalash yondashuvlari. Genom xaritalash sohasida ikkita o'ziga xos xaritalash usuli qo'llaniladi: genetik xaritalar (bog'lanish xaritalari deb ham ataladi) va fizik xaritalar.  Ikkala xarita ham genetik markerlar va gen lokuslari to'plami bo'lsa-da , genetik xaritalarning masofalari genetik bog'liqlik ma'lumotlariga asoslanadi , jismoniy xaritalar esa, odatda, asosiy juftliklar sonida o'lchanadigan haqiqiy jismoniy masofalardan foydalanadi . Jismoniy xarita genomning aniqroq tasviri bo'lishi mumkin bo'lsa-da, genetik xaritalar ko'pincha xromosomaning turli hududlari tabiati haqida tushuncha beradi, masalan, genetik masofa va jismoniy masofa nisbati turli genomik hududlarda juda katta farq qiladi, bu turli rekombinatsiya tezligini aks ettiradi, va bunday ko'rsatkich ko'pincha genomning evromatik (odatda genga boy) va geteroxromatik (odatda genga kambag'al) hududlarini ko'rsatadi.
Genetik xaritalash 
Tadqiqotchilar genetik xaritani taniqli kasallik yoki xususiyatga ega bo'lgan oila a'zolaridan qon, tupurik yoki to'qimalar namunalarini to'plash orqali boshlaydilar. Gen xaritalashda, ayniqsa shaxsiy genomik testlarda ishlatiladigan eng keng tarqalgan namuna tupurikdir. Keyin olimlar DNKni namunalardan ajratib oladilar va uni sinchiklab tekshiradilar, kasallikni tashuvchi oila a'zolarining DNKsida va kasallik tashuvchisi bo'lmaganlarning DNKsida yo'q bo'lgan noyob naqshlarni izlaydilar. DNKdagi bu noyob molekulyar naqshlar polimorfizmlar yoki markerlar deb ataladi.
Genetik xaritani yaratishning birinchi qadamlari genetik belgilarni ishlab chiqish va populyatsiyani xaritalashdir. Ikkita marker xromosomada qanchalik yaqin bo'lsa, ularning birgalikda keyingi avlodga o'tish ehtimoli shunchalik yuqori bo'ladi. Shuning uchun barcha markerlarning "birgalikda ajratish" naqshlari ularning tartibini qayta qurish uchun ishlatilishi mumkin. Shuni hisobga olgan holda, har bir genetik markerning genotiplari ota-onalar uchun ham, keyingi avlodlarda ham har bir shaxs uchun qayd etiladi. Genetik xaritalarning sifati ko'p jihatdan ushbu omillarga bog'liq: xaritadagi genetik belgilar soni va xaritalash populyatsiyasining o'lchami. Ikkala omil bir-biri bilan bog'liq, chunki kattaroq xaritalash populyatsiyasi xaritaning "ravshanligini" oshirishi va xaritaning "to'yinganligi" ning oldini olishi mumkin.
Gen xaritalashda ikkala ota-onadan ishonchli tarzda ajratilishi mumkin bo'lgan har qanday ketma-ketlik xususiyati genetik marker sifatida ishlatilishi mumkin. Genlar, bu borada, ikki ota-ona o'rtasida ishonchli tarzda ajratilishi mumkin bo'lgan "belgilar" bilan ifodalanadi. Ularning boshqa genetik markerlar bilan aloqasi xuddi ular umumiy markerlar bo'lgani kabi hisoblab chiqiladi va haqiqiy gen lokusu so'ngra ikkita eng yaqin qo'shni markerlar orasidagi mintaqada qavslanadi. Keyinchalik, ma'lum bir qo'zg'atuvchi joy aniqlanmaguncha, gen qo'shnisini yuqori aniqlikda xaritalash uchun ushbu mintaqaga qaratilgan ko'proq markerlarga qarash orqali butun jarayon takrorlanadi. Bu jarayon ko'pincha " pozitsion klonlash " deb ataladi va u o'simlik turlarini o'rganishda keng qo'llaniladi. Bir o'simlik turi, xususan, pozitsion klonlash qo'llaniladigan makkajo'xori hisoblanadi . Genetik xaritalashning katta afzalligi shundaki, u genlarning nisbiy holatini faqat ularning fenotipik ta'siriga qarab aniqlay oladi.
Genetik xaritalash - bu qaysi xromosoma qaysi genga ega ekanligini aniq aniqlash va bu gen o'sha xromosomaning qayerda joylashganligini aniq aniqlash usulidir. Xaritalash, shuningdek, ikkita gen orasidagi masofaga qarab qaysi genning rekombinatsiyasini aniqlashning bir usuli sifatida ishlaydi. Ikki gen orasidagi masofa santimorgan yoki xarita birliklari deb nomlanuvchi birliklarda o'lchanadi, bu atamalar bir-birini almashtiradi. Sentimorgan genlar orasidagi masofa bo'lib, ular uchun meyozning yuzta mahsuloti rekombinant bo'ladi. Ikki gen bir-biridan qanchalik uzoq boʻlsa, ularning rekombinatsiyalanish ehtimoli shunchalik yuqori boʻladi. Agar u yaqinroq bo'lsa, buning aksi sodir bo'lardi.