27-amaliy mashg`ulot. Genomni kаrtаlаshtirish Gen xaritalash yoki genom xaritalash xromosomadagi genning joylashishini



Yüklə 28,67 Kb.
səhifə3/4
tarix23.12.2023
ölçüsü28,67 Kb.
#156576
1   2   3   4
27-amaliy dnk xaritalash

Fizik xaritalash 
Haqiqiy tayanch-juftlik masofalari odatda qiyin yoki to'g'ridan-to'g'ri o'lchash mumkin emasligi sababli, fizik xaritalar aslida genomni ierarxik jihatdan kichikroq bo'laklarga bo'lish orqali tuziladi. Har bir bo'lakni tavsiflash va qayta yig'ish orqali, bu kichik bo'laklarning bir-biriga yopishgan yo'li yoki "plitka yo'li" tadqiqotchilarga genomik xususiyatlar orasidagi jismoniy masofani aniqlashga imkon beradi.
Cheklash xaritalash - bu DNK segmentiga tegishli strukturaviy ma'lumotni cheklash fermentlari yordamida olish usuli . Cheklovchi fermentlar DNK segmentlarini aniq tanib olish ketma-ketligida kesishga yordam beradigan fermentlardir . Cheklash xaritalashning asosi DNKni cheklash fermentlari bilan hazm qilishni (yoki kesishni) o'z ichiga oladi. Keyin hazm qilingan DNK bo'laklari elektroforez yordamida agaroz jelida ishlaydi , bu esa ushbu hazm qilingan qismlarning o'lchami haqida ma'lumot beradi. Ushbu bo'laklarning o'lchamlari tahlil qilingan DNKdagi cheklash fermenti joylari orasidagi masofani ko'rsatishga yordam beradi va tadqiqotchilarga tahlil qilingan DNK tuzilishi haqida ma'lumot beradi. [14] Natijada paydo bo'lgan DNK migratsiya sxemasi - uning genetik barmoq izi klonda DNKning qaysi cho'zilganligini aniqlash uchun ishlatiladi . Barmoq izlarini tahlil qilish orqali kontiglar avtomatlashtirilgan (FPC) yoki qo'lda (yo'l izlovchilar) bir-birining ustiga chiqadigan DNK cho'zilishlariga yig'iladi. Endi o'rganilayotgan organizmning DNK ketma-ketligini aniqlash uchun klonlarni samarali ketma-ketlashtirish uchun klonlarning yaxshi tanlovi amalga oshirilishi mumkin .
Jismoniy xaritalashda ma'lum bir genni belgilashning to'g'ridan-to'g'ri usullari yo'q, chunki xaritalash belgilar va funktsiyalarga taalluqli ma'lumotlarni o'z ichiga olmaydi. Genetik markerlar jismoniy xarita bilan in situ hibridizatsiya kabi jarayonlar orqali bog'lanishi mumkin . Ushbu yondashuv yordamida jismoniy xarita kontiglari genetik xaritaga "ankorlangan" bo'lishi mumkin. Jismoniy xarita kontiglarida ishlatiladigan klonlar keyinchalik yangi genetik markerni loyihalash va qo'zg'atuvchi lokuslarni aniqlashga yordam berish uchun mahalliy miqyosda ketma-ketlashtirilishi mumkin.
Makrorestriksiya - bu jismoniy xaritalashning bir turi bo'lib, unda yuqori molekulyar og'irlikdagi DNK cheklash joylari kam bo'lgan cheklash fermenti bilan hazm qilinadi.
Klonlar guruhidagi DNKning klonlarni to'liq ketma-ketligisiz qanday qilib bir-biriga mos kelishini aniqlashning muqobil usullari mavjud . Xarita aniqlangandan so'ng, klonlardan genomning katta qismlarini samarali saqlash uchun manba sifatida foydalanish mumkin. Ushbu turdagi xaritalash genetik xaritalarga qaraganda aniqroqdir.

Yüklə 28,67 Kb.

Dostları ilə paylaş:
1   2   3   4




Verilənlər bazası müəlliflik hüququ ilə müdafiə olunur ©www.genderi.org 2024
rəhbərliyinə müraciət

    Ana səhifə