WYKŁADY: Odporność swoista i nieswoista. Charakterystyka antygenów. Struktura i funkcja przeciwciał. Przeciwciała monoklonalne. Odczyny serologiczne. Techniki immunologiczne. Zaburzenia odporności. AIDS. Pamięć immunologiczna.
ĆWICZENIA:
Podstawowe techniki immunologiczne i odczyny serologiczne.
Cele: Poznanie teoretycznych podstaw immunologii, powiązań pomiędzy układem immunologicznym, nerwowym i krwionośnym. Reakcje serologiczne i ich wykorzystanie w diagnostyce bakterii.
Metody i formy nauczania:
Wykłady z użyciem przeźroczy, folii i technik komputerowej wizualizacji obrazu. Ćwiczenia laboratoryjne z wybranych technik serologicznych.
Forma zaliczania przedmiotu: zaliczenie
Wymagana wiedza: znajomość podstaw mikrobiologii, genetyki, biologii komórki, fizjologii zwierząt
Zapisy na zajęcia: tak
Literatura:
1. Jakóbisiak M. 2002. Immunologia. PWN, Warszawa.
2. Hyde R.M. 1997. Immunologia. Wyd. Med. Urban & Partner, Wrocław.
3. Staines N. i wsp. 1996. Wprowadzenie do immunologii. Wyd. Med. Urban & Parner, Wrocław.
4. Roitt J. i wsp. 1998. Immunologia. Wyd. Med. Słotwiński. Verlag, Brema.
.
Wydział: MFCh
|
Instytut: Fizyki
|
Rodzaj studiów: DZ
|
Kierunek: Biofizyka
|
Specjalność:
|
Nazwa przedmiotu: Biofizyka błon biologicznych
|
Kod Socratesa:
|
Nr przedmiotu:
|
Semestr: V
| Forma zajęć: W + L |
Liczba godzin: 15 + 30
|
Liczba punktów: 3
|
Status przedmiotu: obowiązkowy
Prowadzący: prof. dr hab. Waldemar Karcz, dr Zbigniew Burdach, dr Zenon Trela
Opis przedmiotu:
- budowa i dynamika błon
- transport jonów i metabolitów przez błony : podstawowe mechanizmy transportu, transport bierny, transport aktywny, transport wtórny, kotransport, transport nośnikowy
- dyfuzja i elektrodyfuzja, równanie Nernsta-Plancka, strumienie jonowe
- pomiar potencjału membranowego : omówienie podstawowych technik pomiarowych stosowanych w elektrofizjologii klasycznej (metody mikroelektrodowe, metoda elektrod zewnętrznych, inne metody), doświadczalne sprawdzanie prawa Nernsta
- demonstracja mikroelektrodowej techniki pomiaru potencjału membranowego : przygotowanie mikroelektrod, połączenie układu elektrycznego, pomiar potencjału spoczynkowego na błonie komórkowej Nitellopsis obtusa
- potencjał czynnościowych : mechanizm elektryczny i jonowy generacji potencjału
- technika voltage clamp w badaniach elektrofizjologicznych, dyskusja równania Goldmanna-Hodgkina-Katza.
- rola pomp jonowych w zjawiskach bioelektrogenery : pompy jonowe w komórkach zwierzęcych i roślinnych
- kanały jonowe i ich rola w zjawiskach elektrycznych, omówienie podstawowych typów kanałów jonowych i ich charakterystyk, kanały napięciowozależne i inne
- technika patch clamp : omówienie metody, podstawowe konfiguracje pomiarowe, podstawy eksperymentalne techniki patch clamp, demonstracja aparatury pomiarowej
- charakterystyki elektrofizjologiczne kanałów jonowych otrzymywane techniką patch clamp i ich interpretacja na przykładzie wybranych danych eksperymentalnych
- czynniki fizyczne i chemiczne modyfikujące procesy elektrogenezy w komórkach roślinnych (promieniowanie UV, temperatura, regulatory wzrostu – IAA i FC, związki amfifilowe i inne substancje membranowo-aktywne.
Cele : zapoznanie studentów z fizycznymi postawami zjawisk elektrycznych w żywych organizmach, poznanie podstawowych technik stosowanych w badaniach elektrofizjologicznych.
Metody i formy nauczania:
Wykład prowadzony w oparciu o środki audiowizualne, ćwiczenia laboratoryjne (elektrofizjologia klasyczna, metoda patch-clamp).
Forma zaliczania przedmiotu: Zaliczenie, test zaliczeniowy
Wymogi wstępne dla wybierających przedmiot: Wiedza ogólna z zakresu przedmiotów ścisłych i biologii
Zapisy na zajęcia: tak
Piśmiennictwo:
1. W. Leyko, Biofizyka dla biologów, 1998, PWN
2. K. Dołowy, A. Szewczyk, S. Pikuła, Błony biologiczne, 2001,Wyd. Śląsk
3. M.R. Blatt, Membrane transport in plants, 2004, Blackwell Publishing.
4. J.M. Berg, J.L. Tymoczko, L. Stryer, Biochemia, 2005, PWN
5. Aktualne publikacje i prace przeglądowe.
Wydział: MFCh
|
Instytut: Fizyki
|
Rodzaj studiów: DZ
|
Kierunek: Biofizyka
|
Specjalność: Biofizyka molekularna
|
Nazwa przedmiotu: EPR w badaniach układów biologicznych
|
Kod Socratesa:
|
Nr przedmiotu:
|
Semestr: VI
| Forma zajęć: W + K |
Liczba godzin: 15 + 15
|
Liczba punktów: 3
|
Status przedmiotu: do wyboru
Prowadzący: dr hab. Danuta Skrzypek prof. U.Ś
Opis przedmiotu:
Zjawisko rezonansu magnetycznego. Oddziaływania nadsubtelne. Wpływ pola krystalicznego na widmo EPR. Metody analizy złożonych widm rezonansowych. Zastosowanie spektroskopii EPR w chemii koordynacyjnej (typ koordynacji, charakter wiązań chemicznych, struktura lokalna). Wolne rodniki i sondy spinowe. Spektroskopia EPR w badaniach dynamiki układów biologicznych.
Cele:
Celem kursu jest zapoznanie słuchaczy z jedną z najpowszechniej stosowanych metod badawczych wykorzystywanych w biologii, fizyce i chemii. Zajęcia obejmują poznanie: podstaw fizycznych tej spektroskopii; metod interpretacji otrzymywanych widm rezonansowych; zastosowań EPR w badaniach dynamiki układów biologicznych (procesy starzenia, patologie wielu chorób).
Metody i formy nauczania: Wykład oraz zajęcia konwersacyjne
Forma zaliczania przedmiotu: zaliczenie lub egzamin
Ograniczenia / Wymagana wiedza:
Zaliczony kurs: Podstawy Fizyki
Założenia / Zalecana wiedza:
Zapisy na zajęcia: są wymagane
Literatura:
A. Hrynkiewicz, E. Rokita (red), Fizyczne metody badań w biologii, medycynie i ochronie środowiska, PWN, Warszawa 1999
J. Weil, J. Bolton, J. Wertz, Electron Paramagnetic Resonance: Elementary Theory and Practical Applications, Wiley, 1994
M. Symons, Spektroskopia EPR w chemii i biochemii, PWN, Warszawa 1987
Wydział: MFCh
|
Instytut: Fizyki
|
Rodzaj studiów: DZ
|
Kierunek: Biofizyka
|
Specjalność: Biofizyka molekularna
|
Nazwa przedmiotu: Biofizyka tkanek. Molekularne procesy zachodzące w tkance nerwowej i mięśniowej
|
Kod Socratesa:
|
Nr przedmiotu:
|
Semestr: VI
|
Forma zajęć: W + L
|
Liczba godzin: 15+ 15
|
Liczba punktów: 3
|
Status przedmiotu: obowiązkowy
Prowadzący: dr A. Szurko, dr G.Kramer – Marek
Opis przedmiotu: Opracowane w ramach przedmiotu zagadnienia stanowią przykłady tematów przybliżających studentów do zrozumienia, jaka biofizyczna maszyneria leży u podstaw naszego zachowania i co może się w niej popsuć pod wpływem chorób, urazów, wieku i innych czynników. Omówiono w nim, między innymi, podstawowe właściwości neuronów, neurobiologiczne i biofizyczne mechanizmy zachowań ruchowych, emocji, bólu i stresu, percepcji.
I. Wprowadzenie
Organizacja układu nerwowego
II. Komórkowe aspekty neurobiologii
Równowaga osmotyczna i utrzymanie objętości komórki
Pochodzenie potencjału błonowego
Powstawanie potencjału czynnościowego
Potencjał czynnościowy: eksperymenty ze stabilizacją napięcia
Przekaźnictwo synaptyczne w złączu nerwowo-mięśniowym
Przekaźnictwo synaptyczne w ośrodkowym układzie nerwowym
-
Biofizyka strukturalnych białek mięśniowych
Ultrastruktura mięśnia poprzecznie prążkowanego
Budowa cienkich filamentów. Aktyna
Budowa grubych filamentów. Miozyna
Mechanizm skurczu
Ruch w układach biologicznych - wici i rzęski komórek eukaryotycznych, wici bakteryjne
IV. Układ kontroli ruchów
Nerwowa kontrola skurczu mięśnia
Rdzeniowe mechanizmy kontroli ruchu
Mózgowe mechanizmy kontroli ruchu
Integracja czuciowo-ruchowa
Autonomiczny układ nerwowy
V. Układ czuciowy
Przegląd informacji o układzie czuciowym
Czucie somatyczne
Zmysł wzroku: siatkówka
System wzrokowy: wyższe procesy wzrokowe
Słyszenie i inne czucia wibracji
Czucia chemiczne: smak i powonienie
VI. Plastyczność neuronalna
Rozwój układu nerwowego
Plastyczność synaptyczna
Wyprowadzenie równania Nersta
Wyprowadzenie równania Goldmana
Metody i formy nauczania:
Zajęcia prowadzone w formie wykładu i na pracowni biofizycznej
Forma zaliczania przedmiotu: egzamin pisemny lub ustny
Ograniczenia / Wymagana wiedza:
Zaliczenie wykładów z biofizyki
Założenia / Zalecana wiedza:
Zapisy na zajęcia: TAK
Literatura:
-
Krzysztof Dołowy, Adam Szewczyk, Sławomir Pikuła; Błony biologiczne.
-
Feliks Jaroszyk; Biofizyka.
-
Zofia Jóźwiak, Grzegorz Bartosz; Biofizyka. Wybrane zagadnienia wraz z ćwiczeniami.
-
L. Stryer; Biochemia.
-
W.Leyko; Biofizyka dla biologów.
-
Gary Matthews; Neurobiologia. Od cząsteczek i komórek do układów.
.
Wydział: MFCh
|
Instytut: Fizyki
|
Rodzaj studiów: DZ
|
Kierunek: Biofizyka
|
Specjalność: Biofizyka molekularna
|
Nazwa przedmiotu: Biofizyka białek i błon komórkowych
|
Kod Socratesa:
|
Nr przedmiotu:
|
Semestr: V
| Forma zajęć: W + L |
Liczba godzin: 15+ 15
|
Liczba punktów: 3
|
Status przedmiotu: obowiązkowy
Prowadzący: dr A. Szurko, dr G.Kramer - Marek
Opis przedmiotu: Białka tworzą podstawowe elementy struktur komórkowych, a poprzez komórki – tkanek, narządów i wreszcie całego ustroju, zapewniając organizmom trwałą i równocześnie elastyczną organizację wewnętrzną. Wiele zjawisk biologicznych związanych z funkcją białek, jak kataliza biologiczna, przepuszczalność błon komórkowych, mechanizm odporności, krzepnięcie krwi, przenoszenie bodźców nerwowych, polega na określonych i odwracalnych zmianach konformacji białek. Niezbędnym warunkiem poznania współzależności między strukturą i funkcją białek jest znajomość absolutnej struktury cząsteczki w różnych fazach jej funkcjonowania. Przedmiot Biofizyka białek i błon komórkowych w sposób integralny ujmuje naturę procesów biologicznych opierając się na metodologii zapożyczonej z nauk fizycznych.
Metody i formy nauczania:
Forma zaliczania przedmiotu: Zaliczenie laboratorium wymaga przeprowadzenia szeregu ćwiczeń oraz przygotowania w formie pisemnej sprawozdań z ich wykonania. Laboratorium kończy się pisemnym kolokwium sprawdzającym poziom przyswojonych wiadomości. Ostateczne zaliczenie przedmiotu Biofizyka białek i błon komórkowych warunkuje pozytywna ocena egzaminu końcowego przeprowadzonego w formie ustnej lub pisemnej.
Ograniczenia / Wymagana wiedza:
I. Biofizyka białek
-
Budowa białek
-
Hemoglobina – portret białka allosterycznego
-
Enzymy – podstawowe pojęcia i kinetyka
-
Strategie katalityczne
-
Strategie regulacyjne
II. Biofizyka błon
-
Fizykochemiczna charakterystyka lipidów
-
Budowa i dynamika błony
-
Kanały i pompy błonowe, transport przez błony
-
Kaskady przekazujące sygnał
-
Fałdowanie się i projektowanie białek
-
Zastosowanie znaczników fluorescencyjnych w badaniach błon biologicznych
-
Wybrane metody spektroskopowe do identyfikacji białek
Założenia / Zalecana wiedza: zaliczenie wykładów z chemii organicznej i mikrobiologii
Zapisy na zajęcia: TAK
Literatura:
-
Krzysztof Dołowy, Adam Szewczyk, Sławomir Pikuła; Błony biologiczne.
-
Feliks Jaroszyk; Biofizyka.
-
Zofia Jóźwiak, Grzegorz Bartosz; Biofizyka. Wybrane zagadnienia wraz z ćwiczeniami.
-
L. Stryer; Biochemia.
-
J. Twardowski; Biospektroskopia
-
L. Czuchajowski, J. Śliwiok; Spektroskopia
Wydział: MFCh
|
Instytut: Fizyki
|
Rodzaj studiów: DZ
|
Kierunek: Biofizyka
|
Specjalność: Biofizyka molekularna
|
Nazwa przedmiotu: Wybrane metody analityczne w badaniach układów biologicznych
|
Kod Socratesa:
|
Nr przedmiotu:
|
Semestr: V
|
Forma zajęć: W + L
|
Liczba godzin: 15 + 30
|
Liczba punktów: 3
|
Status przedmiotu: obowiązkowy
Prowadzący: dr A. Szurko, dr G. Kramer – Marek
Opis przedmiotu: Przedmiot Wybrane metody analityczne w badaniach układów biologicznych umożliwia przedstawienie studentom interdyscyplinarnego kierunku studiów, jakim jest biofizyka, szybkich i czułych metod analizy chemicznej oraz licznych metod frakcjonowania mieszanin biologicznych (chromatografia, jako przykład selekcji składników w układzie kilkufazowym doprowadzonym do stanu równowagi, oraz elektroforeza, która obok sedymentacji i dyfuzji jest wyrazem kinetycznego rozdziału substancji w systemie jednofazowym). W ramach przedmiotu omawiane są także wybrane zagadnienia dotyczące analizy podstawowych składników ustrojowych (białek, lipidów, kwasów nukleinowych, enzymów).
I. Wiskozymetria
Lepkość biopolimerów
II. Wirowanie
Wirówki
Ultrawirówki
Określenie mas cząsteczkowych metodą szybkości sedymentacji
Wyznaczenie mas cząsteczkowych metodą równowagi sedymentacyjnej
Sedymentacja w gradiencie gęstości
Równowaga sedymentacyjna w ustalonym gradiencie
-
Kolorymetria
Podstawy teoretyczne
Sposoby obliczania stężeń z odczytanej absorbancji
-
Chromatografia
Wiadomości podstawowe
Chromatografia adsorpcyjna
Chromatografia jonowymienna
Chromatografia podziałowa
Chromatografia cienkowarstwowa
Filtracja żelowa
Chromatografia powinowactwa
Chromatografia wykorzystująca hydrofobowe właściwości cząstek
IV. Elektroforeza
Ogólne zasady
Elektroforeza bibułowa
Analiza elektroforetyczna białek w żelu poliakrylamidowym
Dwuwymiarowa elektroforeza białek
Analiza białek techniką Western blotting
Jakościowa i ilościowa analiza jedno- i dwuwymiarowych elektroferogramów
V. Wybrane zagadnienia dotyczące analizy podstawowych składników ustrojowych białka, lipidy, kwasy nukleinowe, enzymy
VI. Izolowanie i analiza niektórych struktur komórkowych
Założenia / Zalecana wiedza:
Metody i formy nauczania:
Obok wykładu zajęcia prowadzone będą w laboratoriach, gdzie studenci zapoznają się z wymienionymi technikami badawczymi.
Forma zaliczania przedmiotu: egzamin pisemny lub ustny
Ograniczenia / Wymagana wiedza:
Zapisy na zajęcia: TAK
Literatura:
-
Feliks Jaroszyk; Biofizyka.
-
Zofia Jóźwiak, Grzegorz Bartosz; Biofizyka. Wybrane zagadnienia wraz z ćwiczeniami.
-
L. Stryer; Biochemia.
-
W. Leyko; Biofizyka dla biologów.
Wykaz przedmiotów do wyboru dla studentów kierunku
Biofizyka – studia I stopnia
Instytut Fizyki:
-
Teoretyczne podstawy spektroskopii wibracyjnej – dr hab. Aleksander Bródka, prof. UŚ
-
Ruchy molekularne w cieczach i metody ich badań – dr hab. Karol Pasterny, prof. UŚ
-
Metody spektroskopowe w badaniach cieczy złożonych – prof. dr hab. Sylwester Rzoska
-
Struktura, własności i badanie ciekłych kryształów – prof. dr hab. Antoni Kocot
-
Fizyka układów mezoskopowych (nanostruktur) – prof. dr hab. Elżbieta Zipper
-
Procesy losowe w przyrodzie – prof. dr hab. Jerzy Łuczka
-
Strukturalna analiza rentgenowska – prof. dr hab. Alicja Ratuszna
-
Spektroskopowe techniki badawcze – prof. dr hab. Jacek Szade, dr Antoni Winiarski
-
Fizyczne podstawy magnetyzmu – prof. dr hab. Wiesława Zarek
-
Radiospektroskopia i jej zastosowanie w badaniach fizykochemicznych – dr hab. Danuta Skrzypek, prof. UŚ
-
Promieniotwórczość naturalna i spektroskopowe metody jej badania – dr Beata Kozłowska
-
Podstawy radioterapii nowotworów – dr Adam Konefał
-
Metody informatyczne w naukach przyrodniczych – prof. dr hab. Zygmunt Gburski
-
Podstawy diagnostyki i leczenia chorób nowotworowych – dr n. med. A. Zajusz
-
Biomagnetyzm – prof. dr hab. Zofia Drzazga
-
Wybrane zagadnienia fizyki medycznej - prof. dr hab. Zofia Drzazga
-
Oddziaływanie pól magnetycznych niejonizujących z układami biologicznymi - prof. dr hab. Zofia Drzazga
-
Fizyka układów amorficznych - prof. dr hab. S. Rzoska.
-
Biofizyka układów koloidalnych - prof. dr hab. S. Rzoska.
-
Biofizyka białek - prof. dr hab. S. Rzoska.
-
Nanobiosensory na bazie nanorurek węglowych. – dr hab. M. Jastrzębska.
-
Fizyczne podstawy terapii fotodynamicznej – prof. dr hab. A. Ratuszna.
-
Rezonans plazmonowy w nanocząstkach metali – zastosowania biofizyczne. – dr hab. M. Jastrzębska.
-
Spektroskopia dielektryczna w badaniach dynamiki i struktury molekularnej układów biologicznych. – dr hab. M. Jastrzębska
-
Zastosowania mikroskopii sił atomowych do badań układów biologicznych – dr hab. M. Jastrzębska
-
Nowe perspektywy w badaniach strukturalnych układów biologicznych: skaningowa mikroskopia optyczna bliskiego pola SNOM, spektroskopia ramanowska z efektem wzmocnienia bliskiego pola SERS. – dr hab. R. Wrzalik.
Dostları ilə paylaş: |