Chapter 5 — benthic infauna

2011 Mugu Lagoon Benthic Infauna Report                                                                                                 3 

MBC Applied Environmental Sciences, 3000 Red Hill Avenue, Costa Mesa, CA 92626 [phone]

 

(round  worms)  and  phoronids  (horseshoe  worms),  were  each  represented  by  a  single  taxon. 

Arthropods were the most abundant phylum with 1,352 individuals, 49% of the individuals in the 

samples.  Nematodes,  annelids  and  mollusks  were  next  most  abundant  with  717  (26%),  580 

(21%), and 84 (3%) individuals, respectively. The two remaining phyla comprised less than 1% of 

the total abundance. 

 

 

Species Richness. Species richness averaged 17 species per station, and ranged from 

8  species  at  Station  ML3,  the  easternmost  station  in  the  lagoon,  to  23  species  at  both  Station 

ML6  in  the  middle  of  the  western  arm  of  the  lagoon,  and  Station  ML74  in  the  central  lagoon 

(Figure  2,  Table  2  and  Appendix  B).  Species  richness  was  somewhat  variable  by  station  in  the 

lagoon. 

 

 

Abundance.  Abundance  averaged  551  individuals  per  station  (a  density  of  5,508 

individuals/m

2

) and ranged from 42 individuals at Station ML3, to 1,209 individuals at Station ML6 

(Figure 2, Table 2 and Appendix B).

 

 

 

Species Diversity. Shannon-Wiener species diversity (H') averaged 1.51 per station and 

ranged from 1.21 at Station ML14, in the western arm, to 1.68 at Station ML74 (Figure 2, Table 2 

and Appendix B).  

 

Table 2. Infaunal community parameters and community indices. 

 

---

2011 Mugu Lagoon Benthic Infauna Report                                                                                                 4 

MBC Applied Environmental Sciences, 3000 Red Hill Avenue, Costa Mesa, CA 92626 [phone]

 

Biomass.  Infauna  biomass  totaled  22  g  and  averaged  4.4  g  per  station  (44.1  g/m

2

) 

(Figure 2, Table 2 and Appendix B). Values ranged from 1.0 g at Stations ML3 and  ML74 to 17.4 

g at Station ML6. Mollusks contributed 65% to the biomass, a larger share than their proportion of 

the abundance due to occurrence of a few large individuals. Annelids contributed another 26% to 

the total followed by arthropods, the most abundant group, with 8%. The remaining phyla together 

contributed 1% to the total biomass.  

 

Benthic Response Index. The Southern California Benthic Response Index (BRI) is the 

abundance-weighted  average  pollution  tolerance  of  species  occurring  in  a  sample.  For  the 

evaluation the pollution tolerance scores (p

i

) for northern (Point Conception to Newport Bay) bay 

and  harbor  habitats  were  used.  BRI  values  averaged  51.5  for  the  study  area,  and  ranged  from 

32.6  (Category  1,  Reference  Level)  at  Station  ML74  to  77.2  (Category  4,  High  Disturbance)  at 

Station ML15, the station closest to Calleguas Creek in the eastern arm of the lagoon (Table 2, 

Appendices A and B). 

 

Index  of  Biotic  Integrity.  The  Index  of  Biotic  Integrity  (IBI)  uses  species  diversity  and 

abundance  of  key  taxa  to  distinguish  impacted  benthic  communities  from  reference  benthic 

conditions. In Mugu Lagoon, IBI scores ranged from 1 (Category 2, Low Disturbance) at Station 

ML14 to an IBI score of 3 (Category 4, High Disturbance) at Station ML3 (Table 2, Appendices A 

and B). 

  

Relative  Benthic  Index.  Relative  Benthic  Index  (RBI)  values  are  calculated  as  a 

weighted sum of four community parameters (number of species, number of crustacean species, 

number  of  crustacean  individuals  and  number  of  mollusk  species)  and  abundances  of  positive 

and  negative  indicators.  RBI  values  in  the  lagoon  ranged  from  0.09  (Category  3,  Moderate 

Disturbance)  at  Stations  ML6  and  ML14  to  0.01  (Category  4,  High  Disturbance)  at  Station  ML3 

(Table 2, Appendices A and B). 

 

River  Invertebrate  Prediction  and  Classification  System.  The  River  Invertebrate 

Prediction and Classification System (RIVPACS) uses presence or absence of expected species 

based on habitat variables including station location and depth.  RIVPACS scores in the lagoon 

ranged  from  0.86  (Category  2,  Low  Disturbance)  at  Station  ML6  to  0.00  (Category  4,  High 

Disturbance) at Stations ML3 (Table 2, Appendices A and B). 

 

Benthic Community Index Integration. The Benthic Community Index Integration is the 

median value (rounded up in value for all fractions) of the Category scores for the four indices at 

each  station.  Integration  values  at  Mugu  Lagoon  ranged  from  3  (Moderate  Disturbance)  at 

Stations  ML6  and  ML14,  both  in  the  western  arm,  and  Station  ML74  in  the  central  lagoon,  to  4 

(High Disturbance) at Stations ML3 and ML15 in the eastern lagoon (Table 2, Appendices A and 

B).

 

 

 

Community Composition. Twelve species each comprised 1% or more of all individuals 

collected; together they totaled about 24% of the species but 93% of the individuals in the infauna 

collection  (Table  3,  Appendix  B).  They  included  six  arthropods,  four  annelids,  and  one  each  of 

mollusk  and  nematode.  Nematodes  were  the  most  abundant  taxa  accounting  for  26%  of  all 

individuals  collected.  Though  taken  at  all  stations,  abundance  was  overwhelmingly  highest  at 

Station  ML6.  The  cumacean  Oxyurostylis  pacifica,  the  second  most  abundant  species  in  2011 

with more than 17% of all individuals, occurred almost exclusively at Stations ML6 and ML14 in 

the  western  arm  of  Mugu  Lagoon,  and  was  not  found  at  eastern  arm  stations.  Similarly,  the 

amphipod Monocorophium acherusicum, which accounted for 11% of all individuals were nearly 

all from Station ML15, with only two individuals reported at Station ML6. Oligochaetes, accounting 

for another 11% of abundance, and the amphipod Grandidierella japonica with 10% of the total, 

also  showed  preference  based  on  location  in  the  lagoon.  The  remaining  taxa  each  contributed 

less than 10% to the total abundance, with most taxa showing strong preference for a station or 

region of the lagoon. Only nematods were reported at all five stations during the survey.

   

 

---