The platon crystallographic package

and run with the instruction: platon x.spf 
Example of 'x.spf' (triclinic to cubic I)
TITL look for metrical symmetry
CELL 10 10 10 109.5 109.5 109.5
LATT P
DELRED 
Alternatively, provide a RES, CIF, CSD or SPF structured dataset to PLATON and invoke 
DELRED by clicking on the DELRED button in the PLATON opening menu or with the 
instruction DELRED from the keyboard interface. 
1.3.4.10 – MOLSYM
See Section 1.3.4.7 for details.
1.3.4.11 - SPACE GROUP DETERMINATION 
This is a tool that was designed to be part of SYSTEM S for the determination of the space 
group(s) compatible with the observed systematic extinctions in the supplied reflection file.
 
Required data: mame.ins and name.hkl. 
Example files: 
spgr.ins
 with 
spgr.hkl
. 
Invoke: platon spgr.ins 
Output on: 
spgr.lis
. 
1.3.4.12 – ASYM – Sort & Merge Reflection Data
PURPOSE
- Reflection data averaging into a unique set. 
- Elimination of systematic extinction reflections 
- Display of the intensity weighted reciprocal lattice planes. 
- Generation of a Unique SHELXL.HKL formatted reflection file. 
A default operation can be invoked via a left-button-click on ASYM. 
Invocation of ASYM from the keyboard gives access to additional options: 
ASYM (AVF) (ZONEX/ZONEY/ZONEZ) (LIST 0/1/2/3) (THM thm) (VIEW) 
where: 
- AVF will instruct to average Friedel/Bijvoet reflections for non-centrosymmetric 
structures as well. 
- ZONEX Zones are displayed in layers with constant H 
- ZONEY Zones are displayed in layers with constant K 
- ZONEZ Zones are displayed in layers with constant L 
- LIST Various degrees of output (default = 3 = all). 

---

- THM Maximum theta-max. 
- VIEW Generate graphic display of reciprocal lattice plane 
Required data files: e.g. shelxl.ins & shelxl.hkl. 
See also 
ASYM-VIEW & Example
 
1.3.4.13 - ASYM FRIEDEL
Clicking on ASYM-AVF is equivalent to 
CALC ASYM AVF
 i.e. reflection data averaging, 
including Friedel pairs. 
1.3.4.14 - LePageTwin
Search for twin-lattice using the LePage algorithm for searching two-fold axes up to twin-
index = 5. 
TwinRotMat_-Determine_Twin_Matrix_from_Fo/Fc_Data'>1.3.4.15 – TwinRotMat -Determine Twin Matrix from Fo/Fc Data
This function carries out an after-the-fact analysis for missed or unaccounted for twinning. 
It is based on an analysis of reflections with large differences between observed and 
calculated structure factors (i.e. I(obs) >> I(calc)). 
TwinRotMat addresses the same issue as the Windows program ROTAX by Simon Parsons 
and Bob Gould (Cooper et. al, 2004) but is not identical, both in terms of underlying 
algorithms and approach. It might be useful to compare the results of both approaches. 
Ideally, twinning is already discovered in the early stages of data collection and taken care 
of. This applies in particular for data collected on CCD detector systems when not all 
reflection spots are covered by the assumed lattice. Exceptions are cases of (pseudo)
merohedral twinning where signs of twinning turn up in the data processing stages. 
Examples are: problems with the structure determination, poor refinement and (high) 
unexplained density peaks. 
This routine addresses cases of (reticular)(pseudo) merohedral twinning. Cases where data 
are based on a the artificially higher volume twin lattice are not covered. (i.e. monoclinic 
structure in orthorhombic supercell twin lattice - generally accompanied by strange 
systematic extinctions). 
A tentative rotation twin axis and associated matrix is produced. 
The analysis is based on the well known fact that unaccounted for twinning shows up in a 
significant number of reflections with I(obs) much greater than I(calc). In that case, it can be 
assumed that those (relatively weak) reflection are overlapped by strong reflections with 
approximately the same theta value. Each such an occurrence leads to a tentative rotation 
axis. Rotation axis that are observed most frequently are tested for there capability to 
explain all the observed intensity differences. Both an approximate twinning factor (BASF) 
and approximate effect on the R-value are listed. Suitable matrices are listed in green. 
The algorithm searches for reciprocal lattice two-fold twinning axis, indicated in (). 
However, also the nearest direct axis direction within the -5 to +5 index range is reported in 
[]. Subsequently, those axis are also tested for there ability to lower the R-value. The matrix 
with the largest R-drop is reported. Positive Freq numbers (i.e. the number of supporting 

---

indications for the twin operation) indicate a best rotation about the direction in (). Negative 
Freq numbers indicate a best rotation about the vector in []. 
The program needs an '.fcf' file (e.g. shelxl.fcf) [or a .cif + .fcf] for the analysis. 
Cases of merohedral twinning are normally handled in a subsequent BASF/TWIN 
refinement. 
Alternatively, an HKLF 5 type of file for the best solution is written to a file with extension 
'.hkp' to be used for subsequent SHELXL refinement. 
Options are provided to display the twinning effect in reciprocal space. 
Parameters: 
Iobs-Icalc/sigma Crit: PAR(413) = 10.0
Theta Criterium: PAR(414) = 0.05
Indexfit criterium: PAR(415) = 0.1 
The analysis can be invoked in various ways. (The -T option bypasses the alternative 
invocation from the PLATON menu). 
1.
Given an '.fcf' run platon -T compound.fcf 
2.
Given an .cif & .fcf run platon -T compound.cif 
In this case, the missing calculated structure factors will be calculated prior to the 
analysis for twinning. 
Example:
s103b.fcf
. Monoclinic, twinned about (1 0 0). Overlap in 0, 6 & 12 th l-layer. 
PLATON Analysis Result: 
2-Rotation about ( 1 0 0 ) 
Rotation Matrix:
1 0 0.8347
0 -1 0
0 0 -1 
An HKLF 5 type SHELXL file is written. In order to proceed with the SHELXL refinement: 
1.
save the original .hkl file 
2.
1copy file .hkp to .hkl 
3.
copy latest .res to .ins 
4. add 'BASF 0.0' to the '.ins' instruction set. 
5. change 'HKLF' line into 'HKLF 5' (no transformation matrix ! 
1.3.5.1 - MULABS - Blessing's Method for Absorption Correction 
MULABS implements a semi-empirical method for absorption correction using multiple 
scanned reflections (i.e. multiple symmetry, azimuth equivalent reflection data, CCD-
detector datasets) following the excellent algorithm published by Bob Blessing, (Blessing, 
1995)  (and also available in his SORTAV program). 
Related Keyboard Instruction: 
MULABS (mu radius (tmin tmax l0max l1max)) (NOCHECK) 

---