Správa o činnosti organizácie sav
Yüklə 2,91 Mb.
|
2.3.2. Aplikačný typ I.miesto
Inhibítory amyloidného samousporiadania proteínov Projekty: VEGA, 0079, 0077, CEX SAV Nanofluid, ŠF 26220120021, 26220220005, 2622012033, APVV-0171-10 a SK RO- 0012-10, projekt SAS-NSC Taiwan - Computational approaches to study structure, folding and interactions of biopolymers. Riešitelia: Z. Gažová, A. Antošová, K. Šipošová (Oddelenie biofyziky), M. Koneracká, V. Závišová, P. Kopčanský, M. Kubovčíková (Oddelenie fyziky magnetických javov) Patogenéza amyloidných ochorení, ako napr. Alzheimerova choroba alebo cukrovka typu II je spojená s prítomnosťou proteínových amyloidných depozitov, ktoré vedú k dysfunkcii alebo smrti buniek. Experimentálne dáta poukazujú na to, že inhibícia amyloidnej agregácie predstavuje jeden z perspektívnych terapeutických prístupov liečby týchto ochorení. Študovali sme schopnosť štruktúrne odlišných akridínových derivátov (planárne, spiro- a tetrahydro - akridíny) inhibovať amyloidnú agregáciu lyzozýmu in vitro s cieľom zistiť vzťah medzi ich štruktúrou a aktivitou. Zistili sme, že strata planarity kruhového jadra akridínu a transformácia reaktívneho nukleofilného tiosemikarbazidu na stabilnejšie heterocykly vedie k výraznému zníženiu inhibičnej a depolymerizačnej aktivity. Pre najúčinnejšie deriváty sme určili IC50 a DC50 hodnoty, ich účinok na prežívanie buniek a DNA. Podarilo sa nám identifikovať tri planárne akridínové deriváty s vysokou anti-amyloidnou aktivitou, nízkou cytotoxicitou a minimálnou schopnosťou ovplyvňovať bunkové procesy. Sledovali sme tiež vplyv magnetických kvapalín zložených z magnetických nanočastíc s rozdielnym obsahom hovädzieho sérového albumínu (MFBSAs) na inzulínové amyloidné fibrily. Prítomnosť MFBSAs viedla ku značnej deštrukcii inzulínových amyloidných agregátov pričom rozsah depolymerizácie fibríl závisel od fyzikálno-chemických vlastností študovaných magnetických kvapalín (hydrodynamický priemer, zeta potenciál, izoelektrický bod). Najväčší efekt na samotnú deštrukciu amyloidných agregátov mal rozmer nanočastíc. Dosiahnuté výsledky predstavujú východiskový bod pre využitie identifikovaných inhibítorov amyloidného samousporiadania proteínov (efektívne planárne akridíny a aktívne MFBSAs) ako terapeutík vhodných na liečbu amyloidóz. Inhibitors of protein amyloid assemblies Pathogenesis of amyloid-related diseases (such as Alzheimer's disease or diabetes type II) is associated with the presence of protein amyloid assemblies which leads to dysfunction or death of the cells. Recent data indicate that promising therapeutic approach is inhibition of protein amyloid aggregation. We have studied structurally distinct acridine derivatives (planar, spiro- and tetrahydro-acridines) for their potential to inhibit in vitro lysozyme amyloid aggregation with the aim to investigate the acridine structure-activity relationship. It was found that loss of acridine core planarity and transformation of the reactive nucleophilic thiosemicarbazide into more stable heterocycles leads to significant decrease of the acridine inhibiting and depolymerising abilities. For the most effective compounds the IC50 and DC50 values, cell viability and interaction with DNA were specified. We have identified three planar acridine derivatives with high anti-amyloid activities, low cytotoxicity and weak ability to interfere with the processes in the cell. The effect of magnetic fluids consisting of magnetite nanoparticles modified by different amounts of bovine serum albumin (MFBSAs) on insulin amyloid fibrils has been also investigated. Presence of MFBSAs causes the significant destruction of insulin amyloids, the extent of fibril depolymerization was affected by physico–chemical properties of studied magnetic fluids (hydrodynamic diameter, zeta potential and isoelectric point); the nanoparticle size has the greatest influence. The present findings represent a starting point for the application of the identified inhibitors of protein amyloid self-aggregation (effective planar acridines and active MFBSAs) as therapeutic agents targeting amyloid-related diseases. Antosova A., Chelli B., Bystrenová E., Siposova K., Valle F., Imrich J., Vilkova M., Kristian P., Biscarini F., Gazova, Z. Structure-activity relationship of acridine derivatives to amyloid aggregation of lysozyme, Biochimica et Biophysica Acta - General Subjects, 2011, vol. 1810, no. 4, p. 465-474. (4.663 - IF2010) Šipošová, K., Kubovčíková, M., Bednáriková, Z., Koneracká, M., Závišová, V., Kopčanský, P., Gažová, Z. Reduction of insulin amyloid aggregates by albumin magnetic fluid, Book of contributions, 7th International Conference Structure and Stability of Biomacromolecules, September 6-9, 2011, Košice, Slovakia Editors D. Fedunová, Z. Gažová, J. Bágeľová, ÚEF SAV Košice, 2011, p. 74-75. ISBN 978-80-970779-0-7. II.miesto Magnetické kvapaliny - chladiace a izolačné médium pre energetiku Riešitelia: M. Timko, P. Kopčanský, M. Koneracká (Oddelenie fyziky magnetických javov) Projekty: FP 7 MNT ERANET MAFINCO, CEX NANOFLUID, VEGA 2/0077/09, APVV Sk-Pl -0069-09/8158/2010, ŠF ITMS EU 26220120003. Možnosti využitia magnetických kvapalín na báze transformátorových olejov vo výkonovej energetike predpokladajú okrem stanovenia dielektrických vlastnosti poznať ich tepelnú vodivosť a tiež odozvu na štrukturalizáciu magnetických nanočastíc vo vonkajšom magnetickom poli a ich Pomocou malouhlového X-ray rozptylu a útlmu zvukových vĺn v magnetickej kvapaline na báze transformátorového oleja s rôznou koncentráciou magnetických nanočastíc bolo ukázané, že vo vonkajšom magnetickom poli dochádza k formovaniu agregátov vo vorme retiazok magnetických nanočastíc. Získané údaje korešpondujú s teoretickými modelmi Shliomisa, Mondsa a Morozova minimálne pre zriedené magnetické kvapaliny, pričom sa predpokladá, že dimer je základným stavebným blokom poľom indukovanej retiazkovej štruktúry. Na základe výsledkov získaných zo štúdia magnetizácie a rozmerovej distribúcie pomocou magnetogranulometrickej metódy boli porovnané experimentálne výsledkov merania efektívnej tepelnej vodivosti metódou hot ball s existujúcimii teoretickými modelmi. Získané výsledky ukazujú, že započítanie rozmerovej distribúcie magnetických nanočastíc umožnilo oveľa efektivnejšie popísať získané výsledky tepelnej vodivosti v porovnaní s klasickými metódmi. Magnetic fluids – effective isolation and cooling medium for elctrical engineering. The possibilities of using of transformer oil based magnetic fluids in power engineering require estimating the basic dielectric properties as well as the effective thermal conductivity and response on external magnetic field on structuralization process of magnetic nanoparticles. The effect of magnetic field on the structure formation in an oil-based magnetic fluid with various concentrations of magnetite particles was studied. The evaluation of the experimental data obtained from small-angle X-ray scattering and ultrasonic attenuation indicates the formation of chain-like aggregates composed of magnetite particles. The experimental data obtained from ultrasonic spectroscopy fit well with the recent theoretical model by Shliomis, Mond and Morozov but only for a diluted magnetic fluid. In this model it is assumed that a dimer is the main building block of a B-field–induced chain-like structure, thus the estimation of the nematic order parameter does not depend on the actual length of the structure. The semi-empirical equation for the effective thermal conductivity of the Holotescu–Stoian model was applied to a set of four dilutions of a transformer oil based magnetic fluid with magnetite nanoparticles as magnetic phase, using the results obtained for the size distributions from the magnetogranulometry analysis, followed by a comparison with the measured values of the effective thermal conductivity obtained by the hot ball method. The comparison between the results given by the model and the corresponding experimental data showed that by using the approximated size distribution to calculate the effective thermal conductivity the analytical results much closer to the experimental ones are obtained, compared to those given by the Maxwell classical model. HOLOTESCU, S. - STOIAN, F.D. - MARINICA, O. - KUBIČÁR, Ľudovít - KOPČANSKÝ, Peter - TIMKO, Milan. Utilization of the magnetogranulometric analysis to estimate the thermal conductivity of magnetic fluids. In Journal of Magnetism and Magnetic Materials, 2011, vol. 323, no. 10, p. 1343-1347. (1.689 - IF2010). ROZYNEK, Z. - JÓZEFCZAK, Arkadiusz - KNUDSEN, K.D. - SKUMIEL, Andrzej - HORNOWSKI, Tomasz - FOSSUM, J.O. - TIMKO, Milan - KOPČANSKÝ, Peter - KONERACKÁ, Martina. Structuring from nanoparticles in oil-based ferrofluids. In European Physical Journal E : Soft Matter and Biological Physics, 2011, vol. 34, no. 3, art. no. 28. (2.096 - IF2010) 2.3.3. Medzinárodné vedecké projekty I.miesto
Procesy s veľkými pT na jadrových terčíkoch Projekty: VEGA 2/0092/10 Riešitelia: Ján Nemčík (Oddelenie teoretickej fyziky) v spolupráci s FJFI ČVUT, PRAHA a USM, Valparaíso, Chille Bol analyzovaný sučasný stav modelovania a popisu procesov s veľkými pT na jadrách. Skúmali sa rôzne témy a problémy: javy koherencie (tienenie gluónov a CGC); jadrové efekty týkajuce sa ohraničení spôsobených zachovaním energie pri veľkých hodnotách xL a xT; časopriestorový vývoj hadronizácie vysokovirtuálnych ľahkých a ťažkých partonov a odpovedajúcich časových skal; úloha včasnej produkcie a následného oslabenia pre-hadronu v hustej jadrovej matérii.
We analyze the current status of modeling and description of high-pT processes in nuclei. Different topics and problems have been investigated: coherence phenomena (in particular gluon shadowing and CGC); 2. nuclear effects related to restrictions imposed by energy conservation at large xL and xT ; space-time development of hadronization of highly virtual light and heavy partons and the related time scales;the role of early production and subsequent attenuation of pre-hadrons in a dense medium. CEPILA, J. - NEMCIK, Jan - SUMBERA, M. QCD factorization at forward rapidities. In Journal of Physics: Conference Series, 2011, vol. 312, no. 1, art. no. 012013. (2011 - WOS, SCOPUS). ISSN 1742-6588.Type: ADEB CEPILA, J. - NEMCIK, Jan. Nuclear suppression of dileptons at forward rapidities. In Journal of Physics: Conference Series, 2011, vol. 312, no. 2, art. no. 022011. (2011 - WOS, SCOPUS). ISSN 1742-6588.Type: ADEB KOPELIOVICH, B.Z. - NEMCIK, Jan. Challenges of high-pt processes on nuclei. In Journal of Physics G: Nuclear and particle physics, 2011, vol. 38, no. 4, art. no. 043101. (1.770 - IF2010). (2011 - Current Contents, SCOPUS). ISSN 0954-3899.Type: ADCA II.miesto
Kondovský izolátor SmB6 bol v posledných štyridsiatich rokoch podrobený intenzívnemu štúdiu rôznymi experimentálnymi metódami. Avšak aj napriek tomu, stále zostáva mnoho nezodpovedaných otázok ohľadom jeho základného stavu, vplyvu nečistôt a tzv. „in-gap“ stavov. Nedávne merania elektrického odporu a tepelnej kapacity pod vysokým tlakom odhalili veľmi bohatý fázový diagram tohto systému. V spolupráci s Univerzitou Hyogo sme systém SmB6 študovali pomocou jadrovej magnetickej rezonancie (11B-NMR) pod vysokým tlakom. Z merania spin-mriežkového relaxačného času sme odhadli hodnotu izolačnej medzery na 7.5 meV pri tlaku 1 bar a s rastúcim tlakom sa hybridizačná medzera uzatvára. 11B-NMR study of Kondo insulator system SmB6 under pressure Kondo insulator system SmB6 has been studied very intensively upon last 40 years. However there are still many open questions about ground state, impurity influence and so called “in-gap” states. Recently, measurements of electrical resistivity and heat capacity under pressure revealed rich phase diagram of this system. We have studied system SmB6 by 11B-NMR measurements under high pressure in cooperation with the University of Hyogo, Japan. From measurements of spin-lattice relaxation time we estimated value of hybridization gap to be about 7.5 meV at 1 bar and with increasing pressure gap is suppressed. G. PRISTÁŠ, T. Mito, T. Kohara, S. GABÁNI, M. REIFFERS, K. FLACHBART, N. Takeshita, N. Shitsevalova: 11B-NMR Study of SmB6 under Pressure. CSMAG ´10: 14th Czech and Slovak Conference on Magnetism, July 6.-9., 2010, Košice, Slovakia. In Acta Physica Polonica A, 2010, vol. 118, no. 5, p. 895-896. (0.433 - IF2009). ISSN 0587-4246. G. PRISTÁŠ, T. Mito, T. Kohara, S. GABÁNI, M. REIFFERS, K. FLACHBART, N. Takeshita, N. Shitsevalova: Pressure-induced suppression of energy gap in the Kondo insulator SmB6 studied by 11B-NMR. J. Phys. Soc. Jpn. 80, SA078 (2011), (2.905 - IF2010). 2.4. Publikačná činnosť (úplný zoznam je uvedený v Prílohe C) Tabuľka 2e Štatistika vybraných kategórií publikácií
A - pracovisko SAV je uvedené ako pracovisko (adresa) autora, alebo je súčasťou kolaborácie alebo iného združenia, ktoré je uvedené ako pracovisko (adresa) autora B - pracovisko SAV nie je na publikácii uvedené, pretože prameň údaj o pracovisku autora neobsahuje, práca ale vznikla na pracovisku SAV C - pracovisko SAV je uvedené ako materské pracovisko autora odlišné od pracoviska, na ktorom práca vznikla (napr. „on leave...“, „permanent address...“, „present address...“) Tabuľka 2f Ohlasy
*628 citácií z kolaborácií ATLAS, ALICE a CDF boli určené priamo z WOS a nie sú v prílohe B A - pracovisko SAV je uvedené ako pracovisko (adresa) autora, alebo je súčasťou kolaborácie alebo iného združenia, ktoré je uvedené ako pracovisko (adresa) autora, alebo pracovisko SAV nie je na publikácii uvedené, pretože prameň údaj o pracovisku autora neobsahuje, práca ale vznikla na pracovisku SAV B - pracovisko SAV je uvedené ako materské pracovisko autora odlišné od pracoviska, na ktorom práca vznikla (napr. „on leave...“, „permanent address...“, „present address...“) 2.5. Aktívna účasť na vedeckých podujatiach Tabuľka 2g Vedecké podujatia
2.6. Vyžiadané prednášky 2.6.1. Vyžiadané prednášky na medzinárodných vedeckých podujatiach [1] SEDLÁK, Marián. Aqueous solutions: unusual features. In The Sixth Annual Conference on the Physics, Chemistry and Biology of Water 2011, West Dover, Vermont, USA, 20.10.-23.10. 2011, invited lecture. [2] ŠKORVÁNEK, Ivan - MARCIN, Jozef - CAPIK, Marek - VARGA, Marek - TURČANOVÁ, Jana - KOVÁČ, Jozef - ŠVEC, Peter - JANIČKOVIČ, Dušan - KOVÁČ, František - STOYKA, Volodymyr. Tailoring of functional properties in Fe-based soft magnetic alloys by thermal processing under magnetic field. In Fundamental and applied MHD : 8th international pamir conference. Borgo, Corsica, 5.-9.9.2011. - B.V., 2011, vol. 2, P. 903-908, invited lecture. [3] ŠKORVÁNEK, Ivan - MARCIN, Jozef - KOVÁČ, Jozef - ŠVEC, Peter. Recent Progress in FeCo-Based Soft Magnetic Nanocrystalline Alloys. In PM 2011 : European Conference Physics of Magnetism, June 27 - July 1, 2011, Poznan, Poland. Abstracts. - Poznan : IMP PAS, 2011, p. 28. ISBN 83-922407-6-6, invited lecture. [4] ŠKORVÁNEK, Ivan - MARCIN, Jozef - KOVÁČ, Jozef - IDZIKOWSKI, Bogdan - ŠVEC, Peter. Amorphous and nanocrystalline FeCo- and GdFeCo-based alloys with improved application-oriented properties. In ANMM 2011 : 5th International Workshop on Amorphous and Nanostructured Magnetic Materials, 5-7 September 2011, Iasi, Romania. - Iasi : National Institute of Research and Development for Technical Physics, 2011, I.3, p. 19., invited lecture. Yüklə 2,91 Mb. Dostları ilə paylaş:
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||