I bob. Oqsil strukturalarini va uning turlari

struktura funktsiyasi oksilar biriktiruvchi tukimalarning asosiy kurilish materialidir: keratin, kologen, elastin anashular jumlasidan lekin oksilar xujayra skleti, xramosomalar, membrana,ribosomalar, retseptorlar tarkibida boshka moddalar bilan katnashadilar. Oksilarni ularni tartibiga karab ikki kategoriyaga bulish mumkin: sodda oksilar-proteinlar va murakab oksilar proteidlar. Birinchi kategoriyaga tegishli oksilar fakat protein molekulasidan iborat bulib, boshka kushimcha komponentlar tutmaydilar. Murakkab oksillar polipeptid zanjiridan tashkari, unga boglangan peptid bulmagan organik yoki onorganik grupasi saklaydilar. Prostetik grupa yunoncha kushimcha demak. Bu komponentning kimyovi tabiatiga karab murakab oksilar kuydagi grupalarga bulinadi: gliko proteidlar, uglevod, metolo proteidlar, metal ioni, gimo proteinlar, gem, flavoproteinlar-flavinlar fosfor proteinlar, fakat kislota koldigi va lipo proteinlar-lipid grupasini tutadi.
X-nurli kristallografiya va tobora ko'proq kriyo-EM kabi atom modellarini olishga qaratilgan tizimli biologiya usullarining natijalari mavjud ma'lumotlarga sezgir tarzda bog'liq. Faqat ultra yuqori aniqlikda rentgen strukturalarini faqat rentgen nurlari diffraktsiyasi ma'lumotlari yordamida aniq takomillashtirish mumkin, chunki ma'lumotlardan parametrga juda past (Rupp, 2009). Odatda, kristall tuzilmalarni takomillashtirishda kuzatilgan diffraktsiya ma'lumotlarini to'ldirish uchun qo'shimcha ma'lumotlar, eng aniq kimyoviy ma'lumotlar, masalan, bog'lanish masofalari, shuningdek, mavjud bo'lganda, kristallografik bo'lmagan simmetriyadan qo'shimcha cheklovlar qo'llaniladi. Biroq, past piksellar sonida, hatto bu qo'shimcha ma'lumotlar ham atomni tozalash uchun etarli emasligi isbotlanishi mumkin va shuning uchun rekonstruktsiyalar faqat past aniqlikdagi xarita yoki konvertga joylashtirilgan va qattiq jismning aniqlangan alohida bo'linmalari yoki domenlari uchun tuzilmalar yoki modellarni o'z ichiga olishi mumkin. Aynan past o'lchamdagi tuzilmani talqin qilish sohasida kontakt bashoratlari paydo bo'lgan strukturaviy model tomonidan qondirilishi kerak bo'lgan qo'shimcha cheklovlarni taqdim etish orqali eng ko'p taklif qiladi (1-rasm). Shunday qilib, bu bashoratlar nafaqat o'rta va past aniqlikdagi kristall tuzilmalar va kriyo-EM rekonstruksiyalariga, balki SAXS va SANS (Svergun) dan olingan konvertlarning talqiniga ham yordam beradi. va boshqalar. , 2013). Ilovalarni molekula ichidagi aloqa prognozlariga bog'liq bo'lganlarga va molekulalararo cheklovlardan kelib chiqadiganlarga bo'lish mumkin.

Ilova