1. A tantárgy neve: FUNKCIONÁLIS GENOMIKA előadás és szeminárium
|
2. Kódja: BIOLÓGUS MSc
|
3. Heti óraszám: 2+1s óra/hét
|
4. Kreditértéke: 4
|
5. Felvétel feltétele (max 3): GENETIKA előadás teljesítése
|
6. Meghirdetés gyakorisága: minden tavaszi félévben
|
7. Tantárgyért felelős oktató: DR. FEKETE CSABA egyetemi docens
|
8. A tantárgy oktatója (oktatói): DR. FEKETE CSABA egyetemi docens és meghívott előadók
|
9. Az oktatás nyelve: MAGYAR
|
10. A tantárgy képzésben betöltött szerepe, szakmai tartalma és célja. BIOLÓGUS MSc képzés; Differenciált szakmai anyag: Mikrobiológia-molekuláris biológia és Növénybiológia szakirány. A kurzus betinkést enged a Funkcionális Genomikába elméleti és gyakorlati vonatkozásaiba, bemutatja a genomikai szemlélet szempontjából alapvető jelentőségű fogalmakat és elősegíti egy új gondolkodásmód elsajátítását.
|
11. A tantárgy tartalma, tematikája: A kurzus során a hallgatók megismerkednek genomika kutatások elméleti alapjaival, alkalmazási területeivel és módszertanával. Az előadásokon bemutatásra kerülnek a Funkcionális Genomika legújabb eredményei, a fontosabb genomprojektek és modellszervezetek. Megvitatásra kerülnek a funkcionális genomikai megközelítéshez kapcsolódó nagy áteresztőképességű klónozási, könyvtárkészítési, és szekvenálási technikák és stratégiák, a direk és random mutagenezis, az RNAi-technika, gének analízise és térképezése, fehérjék expressziója, különböző microarray eljárások (Affymetrix és cDNS), a transzkriptomikai kísérlettervezés szempontjai, az adatok tárolása, standardizálása és megerősítése (qPCR), valamint az adatok értékelésének és bemutatásának kérdései. A kurzus során kiemelt hangsúlyt kap a “normál” és a pathológiás/stresszelt körülmények során kialakuló sejtfunkció-változások hátterében meghúzódó molekuláris jelenségek bemutatása. A Funkcionális Genomika alapjait és alkalmazási lehetőségeit az ún. piros, fehér és zöld biotechnológia területeit felölelő példékon keresztül szemléltetjük.
|
12. Értékelés: szóbeli vizsga.
|
13. A tantárgy kötelező és ajánlott irodalma: New Frontiers in Functional Genomics (Principles and Practice) by M. R. Wilkins (Editor), K. L. Williams (Editor), R. D. Appel (Editor), D. F. Hochstrasser;
Expression Genetics: Accelerated and High-Throughput Methods (Biotechniques Update Series)
by Michael McClelland (Editor), Arthur B. Pardee (Editor); Functional Genomics: A Practical Approach (The Practical Approach Series, 235) by S. Hunt (Editor), F. Livesey (Editor); DNA Microarrays and Gene Expression by Pierre Baldi, Wesley G. Hatfield. Az előadások anyagának elektronikus formája.
|
A tantárgyleírás készült: 2007. május 18.
|
Készítette: Dr. Fekete Csaba egyetemi docens
tantárgyfelelős
|
Jóváhagyta: …………………………………………….… Dr. Putnoky Péter, szakfelelős (biológus MSc)
|
