Curriculum Vitae of Giovanni Parmigiani

173. Johns Hopkins University, Department of Biomedical Engineering, December 2008:

Gene Set Analysis as a Tool for Cross-Platform Integration in Genomics.

174. Harvard School of Public Health, Department of Biostatistics, September 2008:

Thinking quantitatively about cancer genes.

175. University of Wisconsin, Department of Biostatistics, September 2008:

Thinking quantitatively about cancer genes.

176. Harvard School of Public Health, Department of Biostatistics, September 2009: Integrating diverse

genomic data with gene sets.

177. Dana-Farber Cancer Institute, Department of Biostatistics & Computational Biology, October

2009: Modeling risk in families with cancer.

178. Harvard School of Public Health Program in Quantitative Genomics, November 2009: Cross-study

Differential Gene Expression.

179. Harvard School of Public Health, Department of Biostatistics, January 2010: Assessing Risk in

Families with Cancer.

180. Harvard Center for Biomedical Informatics, Countway Library, July 2010: Modeling Risk in Families

with Cancer.

181. Massachusetts General Hospital, Biostatistics Center, September 2010: Statistical Issues in Cancer

Genome Sequencing Studies.

182. University of Massachusetts Amherst, Department of Mathematics and Statistics, November 2010:

Statistical Issues in Cancer Genome Sequencing Studies.

183. National Human Genome Research Institute, Division of Intramural Research February 2011:

Statistical Issues in Somatic Mutation Studies of Cancer.

184. Memorial Sloan Kettering Cancer Center, Department of Epidemiology and Biostatistics, March

2011: Statistical Issues in Cancer Genome Sequencing Studies.

185. Brown University, Center for Statistical Sciences, April 2011: Statistical Issues in Cancer Genome

Sequencing Studies.

186. University of Connecticut Seminar Series, November 2011: Bayesian Effect Estimation Accounting

for Adjustment Uncertainty

187. The University of Texas MD Anderson Cancer Center, Department of Bioinformatics and Com-

putational Biology, January 2012: Gene set analysis as a tool for cross-platform integration in

genomics.

188. Massachusetts General Hospital Multidisciplinary Breast Rounds, February 2012: Breast Cancer

Risk Models and Web Services.

189. Fred Hutchinson Cancer Research Center, Division of Public Health Sciences, February 2012: Gene

Set Analysis as a Tool for Cross-Platform Integration in Genomics.

190. University of Washington, Department of Biostatistics, March 2012: Bayesian Effect Estimation

Accounting for Adjustment Uncertainty.

191. Harvard School of Public Health Department of Epidemiology, March 2012: Analyzing genome-

wide data by gene set: history, caveats, and recent trends.

192. Department of Statistics, Wharton School at University of Pennsylvania, April 2012: Bayesian

Effect Estimation Accounting for Adjustment Uncertainty.

193. Tufts Medical Center, Biostatistics Research Center, January 2013: Statistical Issues in Cancer

Genome Sequencing Studies.

194. Center for Biomedical Informatics Seminar Series, Harvard Medical School, April, 2013: Validation

of molecular signatures in cancer.

39

---

195. Program in Molecular and Genetic Epidemiology Seminar Series, Harvard School of Public Health,

April 2013: Evaluating the predictiveness of genomic signatures by systematic reviews and cross-

study reproducibility.

196. Clinical Investigators Seminar Series, Dana-Farber Cancer Institute, April 2013: Validation and

Clinical Utility of Genomic Signatures.

197. Department of Biostatistics, Boston University, September 2013: Statistical modeling of somatic

mutation data.

198. Center for Translational and Public Health Genomics, The University of Texas M. D. Anderson

Cancer Center, January 2014: Cross-study Reproducibility of Predictions, with Application to

Genomics.

199. Big Data Seminar Series, Department of Biostatistics, Harvard School of Public Health, February

2014: Cross-study Replicability of Predictions, with Application to Genomics.

200. Neyman Seminar Series, Department of Biostatistics, University of California at Berkeley, December

2014: Cross-study Reproducibility of Predictions, with Application to Genomics.

201. Computational and Systems Biology Seminar Series, UT Southwestern, December 2015: Cross-

study Analysis of Prediction Algorithms in Genomics.

202. The MBI Colloquium, The Ohio State University, April 2016: Cross-study Performance of Predic-

tions, with Application to Genomics.

Interviews

1. NPR story on Axillary Lymph Nodes in Early Breast Cancer, by Diane Toomey, WUNC Radio,

UNC-Chapel Hill. Broadcast on May 6, 1999.

[Transcript]

2. Nodes Under Fire. Short television story on Axillary Lymph Nodes in Early Breast Cancer, by

Ivanhoe Broadcasting

, 1999.

3. Live webcast interview on Familial risk prediction in breast cancer, April 30, 2001.

[Transcript]

.

4. Radio 3 Scienza interview about the Human Protein Interactome, 2006.

[Podcast]

.

5. Cancer Therapy Advisor interview about Adaptive Randomization and the I-SPY 2 Trial Platform,

2016.

[Article]

40

---

TEACHING

Program Leadership

Co-chair of Steering Committee developing the Bioinformatics MHS, School of Public Health,

2002–2004.

Courses

5

COURSES AT CARNEGIE MELLON:

Probability and Applied Statistics for Physical Scientists and Engineers, Summer 1987.

Statistical Concepts with Computer Applications, Summer 1988.

Engineering Statistics and Quality Control, Fall 1990 and Spring 1991.

COURSES AT DUKE:

Statistics and Data Analysis for Economics (STA110-B) Fall 1998.

* Probability and Statistics in Engineering (STA113) Fall 1991–1993, Spring 1992–1994.

Developed Using Probability to Learn from Data (with M. Lavine).

Supplement on Bayesian statistics for the Underate Engineering curriculum.

Statistical Inference (STA215) Spring 1994, Spring 1995.

* Statistical Decision Theory (STA226) Spring 1992, 1993, 1998, and 1999; Fall 1995 and 1996.

Developed notes for Decision Theory: Principles and Approaches (with L. Inoue).

Experimental Design (STA246) Spring 1995 (co-taught).

Topics in Statistics (STA 294) Spring 1995 (co-taught).

COURSES AT JOHNS HOPKINS:

Oncology Fellows Journal Club 1999–present (statistical discussant)

* Decision Theory for Biomedical Applications, 4th term 1999/00.

[Course Website]

Taught from the book: Modeling in Medical Decision Making.

* Statistics for Gene Expression, 4th term 2000/01, 2001/02 and 2002/03.

[2001 Course Website] [2002 Course Website] [2003 Course Website]

* Statistical Topics in Genetics and Genomics, 2th term 2002/03.

Co-taught with K. Broman

* Analysis of Biological Sequences, 2nd term 2004/04 and 2004/05.

Co-taught with S. Chen

* Foundation of Statistics I: Decision Theory, 3rd term 2003/04, 2004/05, 2005/06 and 2006/07;

1st term 2008/09.

5

Starred courses involved substantial course development

41

---